La tradizione lo vuole fondato da popolazioni provenienti dall'Oriente o dal nome di un centurione romano. Di sicuro fu anche abitato dai bizantini durante la loro permanenza nel Salento dal VI all'XII secolo. Notizie storiche si hanno nel 1190 quando re Tancredi lo concede in feudo a Pietro Indrimi, mentre l'ultimo feudatario fu un Gualtieri col titolo baronale. Il casale aperto di Castrignano nasce e si sviluppa comunque in funzione di una serie di strade che lo collegano all'antico asse viario della Lecce-Otranto.